Terdapat banyak pilihan penting dalam "S.T.A.L.K.E.R. 2: Heart of Chernobyl" yang akan sangat mempengaruhi pengalaman permainan pemain. Perlu diingat bahawa pencarian sampingan sebelum pencarian ini akan berbeza-beza bergantung pada pilihan pemain dalam Wishful Thinking.
"The Past Returns" ialah misi utama, yang bermula selepas pemain melengkapkan "The Bleed" atau "Law & Order". Kedua-dua misi akan berakhir dengan pemain perlu melarikan diri dari SIRCAA.
Mula-mula pergi ke penanda misi di pulau terpencil. Di sana, pemain boleh menemui Profesor Lodochka di kem Quit. Apabila sampai ke kawasan itu, bagaimanapun, objektif keutamaan baharu akan muncul: menghapuskan beberapa askar upahan di kawasan itu. Pemain tidak perlu risau tentang musuh ini bersembunyi di mana-mana sudut, kerana mereka semua akan ditandakan dengan penanda pencarian.
Adalah disyorkan bahawa pemain dilengkapi dengan baik kerana ini bukan satu-satunya pemain musuh yang akan dihadapi dalam misi ini. Bunuh semua musuh untuk menyelesaikan objektif semasa dan terima satu token misi yang akan membawa anda ke Lodochka. Pada ketika ini, pemain akan diberikan objektif pilihan - mengaktifkan sistem pengudaraan.
Jika anda ingin menyelesaikan pencarian sampingan ini, buka peta dan semak titik yang anda tandai. Salah satu daripadanya akan membawa anda ke fius di kawasan yang anda berada sekarang. Selepas mengambil fius, buka peta dan anda akan melihat titik bertanda terus ke utara anda. Ini akan menjadi laluan ke bilik kejuruteraan. Pemain perlu berhadapan dengan musuh yang tidak kelihatan yang mengintai di kawasan ini, jadi bersiaplah.
Masuk tempat perlindungan dan ikut laluan ke bilik enjin. Anda boleh menggunakan fius yang anda ambil sebelum ini untuk memulihkan kuasa kepada sistem pengudaraan. Sekarang anda boleh meneruskan misi.
Menyelesaikan objektif pilihan ini tidak akan menghasilkan sebarang ganjaran istimewa, tetapi ia akan memudahkan misi yang lain untuk diselesaikan.
Sebelum menuju ke objektif seterusnya, pemain mungkin ingin mempertimbangkan untuk mendapatkan beberapa senjata yang bagus kerana keadaan boleh menjadi sangat mencabar. Pergi ke tempat yang ditandakan dan anda akan temui pintu masuk gua berhampiran tepi air. Pemain perlu pergi ke barat melalui gua, ikut laluan ke bawah, dan melalui pelbagai kawasan bahaya. Anda akan menemui paip pecah yang boleh anda gunakan untuk mencapai tahap gua yang lebih tinggi.
Pergi ke kawasan yang ditanda dan anda akan temui menara besar berbentuk kon. Pelancar boleh diperolehi pada titik bertanda di sebelah kon ini. Dalam perjalanan keluar, pemain sekali lagi perlu berhadapan dengan musuh yang tidak kelihatan. Pemain kemudiannya perlu kembali ke Lodochka dan bercakap dengannya. Setelah selesai, tugasan akan ditanda sebagai selesai. Misi utama seterusnya ialah "The Hornet's Nest".